Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PctpP53808 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PctpP53808 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PctpP53808 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PctpP53808 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PctpP53808 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PctpP53808 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PctpP53808 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PctpP53808 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PctpP53808 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PctpP53808 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PctpP53808 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PctpP53808 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms