Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RabggtbP53612 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RabggtbP53612 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RabggtbP53612 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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