Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Efnb1P52795 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efnb1P52795 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms