Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SqleP52019 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SqleP52019 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SqleP52019 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SqleP52019 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SqleP52019 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SqleP52019 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SqleP52019 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SqleP52019 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SqleP52019 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SqleP52019 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SqleP52019 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SqleP52019 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SqleP52019 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SqleP52019 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SqleP52019 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SqleP52019 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SqleP52019 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SqleP52019 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SqleP52019 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SqleP52019 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SqleP52019 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SqleP52019 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms