Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apobec1P51908 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Apobec1P51908 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Apobec1P51908 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms