Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccr1P51675 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccr1P51675 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms