Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XpcP51612 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XpcP51612 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XpcP51612 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XpcP51612 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XpcP51612 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XpcP51612 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XpcP51612 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XpcP51612 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
XpcP51612 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XpcP51612 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
XpcP51612 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XpcP51612 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
XpcP51612 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XpcP51612 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
XpcP51612 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
XpcP51612 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XpcP51612 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
XpcP51612 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
XpcP51612 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XpcP51612 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XpcP51612 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
XpcP51612 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
XpcP51612 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
XpcP51612 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
XpcP51612 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XpcP51612 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
XpcP51612 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
XpcP51612 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
XpcP51612 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
XpcP51612 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
XpcP51612 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
XpcP51612 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms