Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Opn1swP51491 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Opn1swP51491 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms