Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnnt2P50752 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tnnt2P50752 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms