Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Defa-rs7P50715 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa-rs7P50715 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms