Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa6P50704 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa6P50704 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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