Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TspoP50637 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TspoP50637 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TspoP50637 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TspoP50637 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TspoP50637 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TspoP50637 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TspoP50637 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms