Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FmodP50608 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FmodP50608 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FmodP50608 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FmodP50608 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FmodP50608 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FmodP50608 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FmodP50608 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FmodP50608 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FmodP50608 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FmodP50608 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FmodP50608 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FmodP50608 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FmodP50608 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FmodP50608 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms