Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SftpdP50404 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SftpdP50404 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpdP50404 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SftpdP50404 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SftpdP50404 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms