Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfbP49766 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VegfbP49766 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfbP49766 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VegfbP49766 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfbP49766 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VegfbP49766 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfbP49766 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfbP49766 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfbP49766 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfbP49766 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfbP49766 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VegfbP49766 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VegfbP49766 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms