Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Brca1P48754 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Brca1P48754 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Brca1P48754 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Brca1P48754 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brca1P48754 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brca1P48754 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms