Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VdrP48281 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VdrP48281 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VdrP48281 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VdrP48281 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VdrP48281 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VdrP48281 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VdrP48281 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VdrP48281 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VdrP48281 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VdrP48281 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VdrP48281 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VdrP48281 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VdrP48281 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VdrP48281 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VdrP48281 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VdrP48281 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VdrP48281 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VdrP48281 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VdrP48281 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VdrP48281 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms