Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gbx2P48031 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gbx2P48031 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbx2P48031 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbx2P48031 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbx2P48031 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbx2P48031 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbx2P48031 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gbx2P48031 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms