Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pax7P47239 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pax7P47239 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms