Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sdc2P43407 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc2P43407 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc2P43407 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms