Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Etv1P41164 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Etv1P41164 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms