Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LtbP41155 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LtbP41155 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LtbP41155 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LtbP41155 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LtbP41155 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LtbP41155 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LtbP41155 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LtbP41155 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LtbP41155 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LtbP41155 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LtbP41155 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LtbP41155 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LtbP41155 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LtbP41155 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LtbP41155 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LtbP41155 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LtbP41155 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
LtbP41155 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms