Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VhlP40338 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VhlP40338 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VhlP40338 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VhlP40338 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VhlP40338 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VhlP40338 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VhlP40338 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VhlP40338 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VhlP40338 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VhlP40338 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VhlP40338 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VhlP40338 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VhlP40338 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VhlP40338 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VhlP40338 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VhlP40338 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms