Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Timp3P39876 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Timp3P39876 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Timp3P39876 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Timp3P39876 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timp3P39876 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms