Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sar1aP36536 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sar1aP36536 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sar1aP36536 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms