Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PtprkP35822 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprkP35822 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprkP35822 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtprkP35822 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PtprkP35822 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprkP35822 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprkP35822 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtprkP35822 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprkP35822 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprkP35822 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms