Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd22P35329 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd22P35329 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd22P35329 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms