Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ptk2P34152 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptk2P34152 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptk2P34152 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptk2P34152 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptk2P34152 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptk2P34152 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptk2P34152 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptk2P34152 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptk2P34152 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptk2P34152 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms