Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx2P30658 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx2P30658 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx2P30658 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms