Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mmp3P28862 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mmp3P28862 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mmp3P28862 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms