Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Marcksl1P28667 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Marcksl1P28667 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Marcksl1P28667 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms