Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col2a1P28481 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col2a1P28481 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms