Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Mgat1P27808 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mgat1P27808 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms