Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pde6aP27664 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pde6aP27664 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde6aP27664 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms