Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Twist1P26687 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Twist1P26687 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Twist1P26687 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms