Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af2P26369 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2af2P26369 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms