Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChgaP26339 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChgaP26339 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ChgaP26339 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChgaP26339 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms