Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra2P26048 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra2P26048 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra2P26048 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms