Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pou2f1P25425 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou2f1P25425 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms