Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irf2P23906 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Irf2P23906 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms