Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gria1P23818 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gria1P23818 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gria1P23818 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gria1P23818 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gria1P23818 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gria1P23818 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms