Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd11P23813 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd11P23813 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm21118-202ENSMUST00000187418 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxd11P23813 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxd11P23813 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms