Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pde6bP23440 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde6bP23440 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde6bP23440 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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