Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Edn1P22387 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms