Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gadd45bP22339 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gadd45bP22339 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gadd45bP22339 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gadd45bP22339 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms