Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ms4a2P20490 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ms4a2P20490 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ms4a2P20490 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms