Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TP20293 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TP20293 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TP20293 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TP20293 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TP20293 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TP20293 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TP20293 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP20293 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP20293 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP20293 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP20293 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TP20293 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP20293 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP20293 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP20293 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TP20293 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP20293 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP20293 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TP20293 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TP20293 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TP20293 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TP20293 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TP20293 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TP20293 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 270.7 ms