Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rpl13aP19253 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpl13aP19253 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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