Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt19P19001 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt19P19001 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt19P19001 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt19P19001 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt19P19001 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt19P19001 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Krt19P19001 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt19P19001 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt19P19001 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt19P19001 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt19P19001 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms