Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rps6ka3P18654 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rps6ka3P18654 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms